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解剖病理部早年成立的宗旨，乃是為台北市立醫院培訓病理醫師。自成立以來，共有八位病理醫師經由本部門訓練且取得病理專科醫師執照，現任職於各大醫院，本部門已完成草創時期的目標。目前以提供各中小型醫院與診所優良的病理檢診服務為主，近年來又研發分子病理診斷，期以更先進的診斷方式，配合提供進步的臨床醫療需要，成為臺灣地區的標竿實驗室。解剖病理部目前為臺灣地區最大的婦女子宮頸抹片篩檢中心之一，工作人員陣容堅強，共有病理醫師 6 人，細胞醫檢師12人，醫檢師8人，技術員2人，文書人員6人，檢體收件員1人。
| 職稱 | 姓名 | 經歷 |
| 部主任 | 謝怡悅 | 林口長庚醫院病理系主治醫師 |
| 主治醫師 | 吳孝平 | 台北市立聯合醫院和平院區解剖病理科科主任 |
| 主治醫師 | 龔士雅 | 台北榮民總醫院病理部專科醫師 |
| 主治醫師 | 吳君潔 | 林口長庚醫院病理系主治醫師 |
| 主治醫師 | 李啟弘 | 雙和醫院病理科主治醫師 |
| 主治醫師 | 黃文志 | 亞東醫院解剖病理科主治醫師 |
主要業務
外科病理
1. 病理切片檢診2. 冰凍切片檢診3. 特別染色4. 免疫組織化學染色5.組織蠟塊及石蠟切片製作
液基薄層抹片製片儀
Cellprep PLUS
細胞病理
(一) 子宮頸抹片檢查 婦女子宮頸抹片篩檢，是早期發現子宮頸癌最簡便最有效的方法，全民健康保險於民國84年開始，提供30 歲以上婦女每年一次子宮頸抹片檢查。本中心為行政院衛生署國民健康局所認可之病理醫療機構，所檢驗之結果皆可經由線上直接申報篩檢個案資料。
(二) 液態薄層抹片
有別於直接塗抹在玻片上的傳統抹片，將採樣後的細胞檢體，裝進一個盛有特殊保存液的瓶子內，而不是塗在玻片上，經微電腦抹片製作儀，將檢體製作為薄層抹片。
(三) 非婦科抹片 除了子宮頸抹片以外之剝落細胞學檢查均屬之，包含兩大類，第一大類體液細胞檢查，含痰、尿、腹水、腦脊髓液、胸水、心包膜積水、氣管刷取及氣管沖洗液等。第二大類穿刺細胞檢查，含甲狀腺、淋巴腺、乳房、肺臟、肝臟、胰臟、腫瘤等穿刺細胞檢查。
(四) 人類乳突病毒篩檢 經過醫界半世紀的努力，子宮頸癌的致病原因，已經確認和人類乳突病毒有高度的相關性，人類乳突病毒是雙股DNA 病毒，有超過100 種型別，其中30-40 型別式透過性行為傳染，其中和引發癌症相關的型別稱為「高危險型」約13 種，分別為16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、68。經由人類乳突病毒檢驗篩檢，更早檢查身體遭病毒感染的警訊，幫助女性早期發現，早期治療。
分子病理
(一) 肺癌間變性淋巴瘤激酶（ALK）蛋白的檢測
ALK |
使用OptiView DAB IHC 檢測套組檢測，並搭配自動免疫組織化學染色機系統，主要針對經過福馬林固定與石蠟包埋之非小細胞肺癌組織檢體，抗-ALK（D5F3）兔子單株抗體是一個一級單株抗體，它能和檢體中ALK 結合，並藉由使用OptiView DAB IHC 檢測組及OptiView 放大套組，此特異性抗體便可以在光學顯微鏡下肉眼觀察。此檢測可輔助篩選適合XALKORI(crizotinib） 治療的患者。 |
(二) 乳癌HER-2/neu 的基因擴增檢測
使用HER2 Dual ISH DNA Probe Cocktail 檢測。針對經過福馬林固定與石蠟包埋之人類乳癌和胃癌組織檢體，搭配全自動多功能組織病理染色系統，利用雙色原位雜交染色技術，可直接在光學顯微鏡下量化HER2 基因擴增的現象。此檢查主要為評估病患是否適合接受Herceptin(trastuzumab) 治療。
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| DISH | |
(三) 肺癌PD-L1蛋白檢測
PD-L1是一種表現在腫瘤細胞上的生物免疫標記。透過檢測癌症細胞是否具有PD-L1蛋白，可協助臨床醫師判斷病人是否適用目前的免疫抗癌療法。現在對非小細胞肺癌進行PD-LI檢測的方法主要為免疫組織化學染色，在經福馬林固定及石蠟包埋處理後的組織檢體，透過自動化的染色系統，有多家廠商生產的不同PD-L1抗體株可供選擇，染色結果可作為使用不同的肺癌免疫治療用藥之參考依據。
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(四) 大腸直腸癌MMR核酸誤配修復基因檢測
遺傳性非息肉大腸直腸癌 (Hereditary nonpolyposis colorectal cancer; HNPCC) 是遺傳性大腸直腸癌最常見的疾病之一，約佔所有大腸直腸癌的2-5%。主要是由於核酸誤配修復基因 (Mismatch repair gene；MMR gene)突變所導致，這些基因產物主要負責細胞內基因修復相關工作，包含：MLH1、MSH2、MSH6、PMS2，這四個基因突變是目前被證實誘發HNPCC產生的主要基因，因此利用 IHC 檢測癌組織中 MMR基因 之蛋白質表現，若喪失則表示其相對的基因有突變而失去其功能。
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| MMR |
(五) 肺癌ROS1 蛋白檢測
ROS1 是一種胰島素受體家族中的酪胺酸激酶受體。在非小細胞肺癌中，多種ROS1 基因的融合配偶體已確認，這些融合蛋白具有激酶活性，可增強細胞生長與增殖並減少細胞凋亡。此檢測可輔助篩選適合 XALKORI(crizotinib） 治療的患者。
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| ROS1 |
本部門亦提供各大學及研究單位之蠟塊代製業務， 不僅只判讀診斷，更協助學術單位之切片品質提升， 以期有更好的研究結果發表，以符合本中心之服務宗旨。服務項目包含人類或動物的組織切片代製、HE 染色、免疫組織化學染色、冰凍切片及各類特殊染色如 Masson-trichrome 及PAS 等染色。
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免疫染色機 VENTANA BenchMark® ULTRA |
免疫染色機 Dako Autostainer Link48 |
檢驗服務項目
外科病理
病理切片
冷凍切片
免疫組織化學染色(IHC)
表皮生長因子接受器(EGFR)
間變性淋巴瘤激酶(ALK)
核酸誤配修復基因(MMR)
PD-L1 (22C3、SP263、28-8、SP142)
ROS1
乳癌表皮受體基因擴增雜交試驗(Her2 DISH)
蠟塊代製業務
細胞病理
子宮頸抹片檢查
液基薄層抹片檢查
非婦科抹片體液檢查
非婦科穿刺細胞檢查
人類乳突病毒 DNA 檢測